Точная дата основания церкви Сергия с Залужья неизвестна, но предположительно храм был основан где-то в 16 веке, а до этого на этом месте находилось монастырское кладбище. Раньше, близ места расположения храма находилось большое болото, которое тогда называлие «лужищем», оттого пошло и название церки — «с Залужья».

Церковь пытались реставрировать несколько раз. Первый в 1885-1886, он простоял до самого 1945-го, когда рухнули своды церкви и звонница. В 1960 храм был взят под охрану и была предпринята еще одна попытка реставрации, но она была не закончена.

На главе церкви до сих пор сохранилось древнее покрытие зеленым лемехом (керамическими пластинами), но в целом ее состояние оставляет желать лучшего. Тем нее менее, памятник является объектом культурного наследия РФ, и с января 2015 начались новые реставрационные работы, так что можно надеятся, что вскоре замечательный памятник архитектору вернет себе прежний облик.